科学合作的最佳状态:家笼监测审查
诺德斯是来推进你的研究的。这不仅可以通过创新技术实现,还可以通过学术贡献实现。上周,多名作者对表型研究的综述发表在了《行为神经科学前沿》(Frontiers in Behavioral Neuroscience)上,这是由29名作者与诺德斯(Noldus)的一个研究笼子行为的专家团队共同完成的。
检讨家居笼监测
再现性危机
Grieco等人解决了生物医学研究中的可重复性危机(或复制危机),深入研究了几个已知和未知的混杂环境因素来源,增加了方差。这通常会导致无法复制或复制先前研究的结果。造成这种情况的两个主要原因是人为干扰和新奇引起的焦虑。
为了改善这种情况,像Noldus的自动笼子监控系统表型集成了强大的基于视频的跟踪软件:EthoVision XT.这使得进行长时间和纵向记录成为可能,提供自发行为的信息,可以跨多个时间尺度进行分析,并提取运动、情感、社交和认知行为的数字生物标记。
图片来自Grieco et al[1]。Noldus的表型由EthoVision XT提供支持
是什么让一个笼子成为一个家的笼子
家居笼监控系统的定义和最终设计是接近更“自然相关”的测试环境的关键。主要特点包括:
- 床上用品材料
- 食物和饮用水的条件完全相同
- 环境浓缩
- 足够的通风笼
- 笼大小
此外,家庭笼子监测系统可以扩展,如运行的轮子来测量活动,连续的食物和水的摄入测量,记录超声波叫声和认知墙来测量学习和记忆在家庭笼子环境中,这使得该设置从笼子外测试脱颖而出。
图片来自Grieco et al[1]。带认知墙的家笼监控系统
标准测试
这种笼子外的原理被认为是行为测试的标准。然而,这些“标准”测试,如开放场地或高架加迷宫,只能在预先确定的时间点捕捉简短的行为快照。家笼监控允许连续监控行为,增加了难以置信的行为输出的分辨率。用标准(短)测试无法观察到的身体姿势变化和/或与笼内刺激装置的相互作用等次要观察结果,可以包括在家用笼监测的输出中。此外,以前未知的(药理学或遗传)模型可以完全表型化。
控制变化
根据这篇论文的作者,实验室内部和内部的变异需要注意。研究人员想要控制的环境变量有一长串:温度、湿度、笼子类型、笼子清洁、笼子位置、住房房间、气味、实验设计、操作、照明、一天的时间、测试顺序,等等。在进行动物实验时,这些变量的范围可能令人生畏,而且确实会导致很多差异,即使是在同一个实验室进行的类似研究之间也会产生差异。
家笼监测的目的是限制实验人员的互动,并使用统一的协议。例如,对待动物就是这样一种互动,对焦虑有重大影响。表型已经促进了活动相关表型(但不是焦虑相关表型)在开放场地测试中的再现性,表明它确实消除了影响可靠性的环境因素。
来自Grieco等人[1]的图像显示了在两个实验室之间使用相同表型系统设置的威力
限制
作者还描述了家用笼监测的局限性。比如特定的行为约束,这在更自然的环境中是不会出现的,比如可见的洞穴系统。此外,作为人类,我们预先定义了行为读数,这可能会产生偏见。此外,家庭笼子监控只提供有限的测试空间,而有些测试需要更大的空间。
今天与未来
家笼监测系统重塑了啮齿类动物行为研究,有助于将世界各地实验室的测试标准化。视频跟踪软件的强大功能进一步强调了这一点,比如EthoVision XT,它不仅具有强大的检测算法和行为识别,而且还提供了一系列先进的分析可能性,如过滤和数据嵌套。
Grieco等人的论文作者还指出,行为测试的未来应该解决他们论文中提到的局限性。虽然我们想要完全消除人为干扰,但这永远不可能100%实现(例如,想想笼子的清洁)。在您的研究设计中实用主义仍然是关键:自动化方法最适合回答您的科学问题吗?
完全访问
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参考
1.Grieco, F.等人(2021年)。在笼子里测量行为:研究设计,应用,挑战和展望。前面。Behav。>。,15:735387.
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