追踪各种各样的动物

视频跟踪用于在更多不同的测试场地中跟踪各种各样的动物物种。一位研究人员想要追踪叶盘上1毫米长的昆虫，另一位则对笼子里的猴子或水族馆里的斑马鱼感兴趣。很明显，为检测小昆虫而创建的设置可能不适合检测猴子或斑马鱼。

不同的设置需要不同的检测方法

EthoVision XT跟踪和分析软件有四种方法来优化检测您的动物。每种方法都有自己的好处。通过这种方式，该项目提供了在非常不同的环境下追踪许多不同物种的可能性。下面我们总结了哪种方法最适合于哪种情况，并给出了一些使用这些方法进行研究的例子。

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灰色的扩展

在四种检测方法中，灰度变换的鲁棒性最强。这种方法通过动物的灰度值来识别动物。当动物与背景对比良好，竞技场中没有与动物大小和灰度相同的物体时，这种方法非常适用。此外，背景不应该改变，例如因为床上用品在笼子里被踢来踢去。Lavorato等人[1]成功地用这种方法跟踪了水中的蝌蚪。此外，Kloth等人[2]使用灰色缩放技术同时创建了20条蚜虫轨迹，这些蚜虫分别保存在小叶盘上。

静态减法

如果竞技场上的其他物体与该动物的颜色相似，则灰度缩放不适合。如果是这种情况，例如，因为竞技场中有一个新物体，就可以使用静态减法进行跟踪。在该方法中，使用了一个没有动物的背景参考图像。当你的动物出现在竞技场上时，EthoVision XT通过从动物图像中减去参考图像来检测它。Mathur等人[3]用这种方法跟踪水族馆中的成年斑马鱼。当你可以创建一个没有动物的竞技场的参考图像时，这种方法非常有效。但这并不总是必要的。然而，在整个实验过程中，背景必须保持不变。当这是不可能的，动态减法，如下所述，是更合适的。

动态减法

在动态减法中，背景是定期更新的。因此，灯光或背景的变化被校正了。你可以使用这种方法，例如，当你跟踪老鼠或老鼠在笼子里移动寝榻材料在测试中。此外，当测试过程中灯光发生变化时，您可能需要动态减法。这种方法也非常适合当你不能制作一个没有你的动物的竞技场的参考图像。Ettrup等人[4]使用动态减法跟踪2 x 1.5米围栏中的迷你猪，可能是因为将所有迷你猪从围栏中移除以制作没有动物的参考图像是不太现实的。此外，Hammamieh, Rasha等人[5]使用这种方法跟踪住在笼子里的老鼠，笼子里放着一只入侵的老鼠。

差分

检测方法的差异是处理器最密集的检测方法。对于每个像素，EthoVision计算其与参考图像差异足够大的概率，从而有可能是动物的一部分。当你的动物不能很好地通过其他方法中的一种在竞技场的所有地方被发现时，尝试区别。当竞技场中有强烈的光线梯度时，比如一个阴影，或者当你的动物有不止一种颜色时，比如戴帽的老鼠，区分特别适合。Assareh等人[6]成功地利用差分法跟踪了有机玻璃箱中的Lister罩头大鼠。

适合你需要的方法

研究实例表明，EthoVision XT可以在非常不同的环境下成功使用，从叶片上4毫米的蚜虫，到水族馆中的斑马鱼，在家庭笼子中的大鼠或小鼠，以及在2 x 1.5米围栏中的迷你猪。总有一种检测方法完全适合你的研究设置，即使在跟踪具有挑战性的情况下，例如，因为实验过程中背景发生了变化，或者当你的动物有不止一种颜色时。

参考文献

1. Lavorato m;Bernabo i;Crescente, a;Denoel m;Tripepi,美国;布鲁内利，E.(2013)。硫丹对斑点蛙蝌蚪的影响:定量发育和行为分析。环境污染与毒理学档案，64 (2), 253 - 262。
2. Kloth kj;十布鲁克，C.J.M.;Thoen M.P.M.;汉哈特-范登布林克，M.;Wiegers基准线;Krips O.E.;Noldus,石油醚;迪克,m;琼斯玛，M.A.(2013)。通过自动视频跟踪研究植物抗蚜虫的高通量表型。植物的方法,11 (4)， doi: 10.1186/s13007-015-0044-z
3. Mathur, Priya, Michael A. Berberoglu和Su Guo。，2011 Preference for ethanol in zebrafish following a single exposure.行为大脑研究，217 (1), 128 - 133。
4. 埃特鲁普，K. S.， S. rensen, J. C.，罗德尔，A.，阿尔斯特鲁普，A. K. O.和比亚尔卡姆，C. R.(2012)。下丘脑深度脑刺激影响Göttingen迷你猪参与攻击和心脑血管控制调节的自主和边缘回路。立体定向和功能神经外科，90 (5), 281 - 291。
5. R. Hammamieh, N. Chakraborty, T. Lima, J. Meyerhoff, A. Gautam, Muhie, S.， & Jett, M.， 2012。小鼠重复暴露于同一训练的攻击者模型模拟创伤后应激障碍的特征。行为大脑研究，235, 55 - 66。
6. 阿萨雷，N.，埃尔巴什，M. M.，马斯登，c.a，和肯德尔，D.(2012)。长期给药丙氨嘧啶和利莫那班对大鼠脑区行为和蛋白表达的影响。药理学、生物化学和行为学“，，100 (3), 506 - 512。