ethvision XT和莫里斯水迷宫:专家提示和技巧

ethvision XT和莫里斯水迷宫:专家提示和技巧

发布的 科琳在筹划 2021年8月11日星期三- 3分钟阅读

莫里斯水迷宫[1]于1981年由理查德·莫里斯开发,是一种可靠的方法,用于评估啮齿类动物的空间学习和记忆。

这项任务包括一个充满不透明水的大圆形水池(通常用牛奶或无毒涂料着色)。在迷宫的某个地方放置一个平台,低于水平面,这样啮齿动物就看不到它了。

如何进行这项测试有各种各样的协议,但通常的协议是将啮齿动物从不同的入口放入水中,然后测量它到达平台所需的时间。如果动物在60秒内没有到达平台,它们将被引导到平台并被移走。经过一定数量的训练试验后,探测试验就完成了。在探头试验中,平台被移走,啮齿动物在平台附近游泳的时间被量化。

跟踪和可视化:1981年至2021年

当理查德·莫里斯第一次开始在迷宫中追踪啮齿类动物时,需要一个由图像分析仪和微型计算机组成的复杂系统来监测对比的程度——戴头巾的老鼠的黑色头部与牛奶色的白色水的对比。


莫里沃水迷宫1984 图片来自莫里斯1984 [2]

自1981年以来,技术已经有了很大的进步,现在你可以使用Noldus的EthoVision XT自动量化此任务。EthoVision XT仍然使用对比,像原来的方法,但包括许多新功能,如深度学习,三体点检测,和各种可视化模式。

提示和技巧

下面是为你的实验获得最佳数据的一些提示和技巧,以及如何生成高质量的可视化结果。

1.使用轨迹平滑去除多余的轨迹点。

在任何基于水的任务中使用视频分析的一个常见问题是水很容易反射光。理想的照明条件可以防止迷宫上方直接的头顶荧光灯,但这并不总是容易实现。为了避免跟踪水而不是动物的反射光,你可以使用跟踪平滑函数移除任何离群数据点。

跟踪平滑概要文件在获取选项卡下,并选择最大距离移动盒子。通过检查这一点,EthoVision将删除距离上一帧X厘米的任何点,您可以手动定义设置X的数字。例如,如果您将X设置为20厘米,EthoVision将自动删除任何跟踪点,距离上一帧对应的点20厘米通过运行平滑配置文件。在典型帧率为30帧/秒的情况下,30毫秒内不太可能出现20厘米的位置差异,因此很可能是光线反射或其他人造物(如粪便物质)。

2.插入缺失的样本

一旦样本被移除,您就可以进入跟踪编辑器,插值缺失的样本。插值样本直接使用缺失样本前后帧的坐标来线性估计缺失点应该是什么。

要插值样本,请转到跟踪编辑器,单击丢失的样本之前的帧,并拖动该单元格、丢失的样本单元格和丢失的单元格之后的帧以粉色突出显示。然后单击此符号进行插值。你也可以通过按CTRL+I来插值。

3.使用热图可以方便地可视化花在平台上的时间。

在EthoVision 10中引入了热图,可以让你直观地了解啮齿动物在迷宫中度过的时间。你甚至可以合并实验组和控制组的热图,这样你就可以很容易地看到不同组之间花费的时间变化。

中,要合并热图以为每组创建一个热图,需要将每个试验分配给一个组(例如控制组和试验组)试验清单.一旦这些都完成了,去数据概要创建两个结果箱,一个用于对照试验,一个用于实验。

审判ethovision列表

数据概要ethovision

完成数据配置文件后,转到热图可视化并点击集团的意思在右边。这将合并您的组数据,为两个不同的组创建一个热图。然后你可以通过访问重叠重要的迷宫特征显示/隐藏在右上角,并选择舞台上的特性结果图像是一个很好的方式来强调群体的变化,为你的论文,演示和海报。


莫里斯水迷宫热图

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参考文献

莫里斯,R.G.M.(1981)。空间定位并不依赖于局部线索的存在。《学习与动机》12,239-260。

莫里斯(1984)。研究大鼠空间学习的水迷宫程序的进展。神经科学学报,11,47-60

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