植物抗害虫品系的高通量筛选
在诺迪斯IT工作的一大好处是它参与了科学研究项目。因为我们所提供的工具是用于科学研究的,所以合乎逻辑的是,我们也要参与为这些工具开发的项目。
植物抗害虫品系的高通量筛选
我亲自参与了其中一个项目,EthoGenomics。因为它的主要研究领域昆虫学(对外行人来说,“对昆虫的科学研究”)与我自己的科学背景相匹配,所以我对这个项目有一个弱点。两位博士生Karen kroth和Manus Thoen最近为他们的优秀论文进行了辩护,并取得了巨大成功。
植物抗虫性
EthoGenomics项目的重点是筛选寄主植物对害虫物种的抗性。传统上,植物系是通过终点测量来筛选的,比如计算植物上的昆虫数量,或者在虫害发生几周后评估昆虫的危害。然而,这是非常劳动密集型的,它需要一个温室数量级的空间,而且结果并不能洞察阻力的背景。这使得人们很难找到可以用来创造新的抗虫植物品系的抗虫基因。
视频跟踪高吞吐量
视频跟踪提供了扩大筛选方法的可能性。然而,需要有一个参数,它是电阻的代理,也可以通过视频跟踪自动测量。Karen为蚜虫寻找了这样的参数,Manus也为蓟马做了同样的研究。两者都成功了。凯伦发现,叶盘上长探针的数量是衡量寄主植物抗蚜虫能力的一个很好的指标。通过确定蚜虫不在叶盘上移动的时间,这些长探针可以通过视频跟踪自动测量。阅读更多相关信息在这篇博客.与此同时,Manus开发了一种高通量的二选法,可以通过视频跟踪自动筛选植物品系对蓟马的抗药性。在这两种情况下,近100条生产线可以在相对较短的时间内,在大约1平方米的工作台面积内同时进行筛选。
骄傲
我们非常自豪,这个项目如此成功,并产生了高质量的科学论文。在后续项目中,我们将进一步开发这些方法,并在商业蔬菜和观赏植物上进行试验。我们将随时与您联系。
阅读更多
- Kloth, K. J. Broeke, C. J. Thoen, M. P., Hanhart-van den Brink, M., Wiegers, G. L., Krips, O. E., Noldus, P. J. J., Dicke, M. & Jongsma, m.a.(2015)。通过自动视频跟踪研究植物抗蚜虫的高通量表型.工厂方法,11 (1)1。
- 索恩,M. P.,克洛思,K. J.,维格斯,G. L.,克里普斯,O. E.,诺德斯,L. P. J.,迪克,M.,和宗马,M. A.(2016)。自动视频跟踪蓟马的行为,以评估在多重平行的两种选择设置中宿主-植物的抗性。工厂方法,12 (1)1。
- 拟南芥对西花蓟马的寄主-植物抗性。Thoen, m.p .(2016)博士论文,荷兰瓦赫宁根大学。http://library.wur.nl/WebQuery/clc/2177085
- 博客:如何有效地筛选植物对蚜虫的抵抗力
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