三维追踪斑马鱼

斑马鱼是一种令人兴奋，但仍相对较新的模式生物，在行为神经科学中越来越受欢迎。我们强调了最近广泛使用斑马鱼的行为研究，但与其他模型相比，很少有教科书或协议可供进入该领域的人使用。与小鼠和大鼠的表型相比，斑马鱼群落还有很长的路要走。不仅涉及到协议开发和手册的可用性，而且涉及到专业培训。

在斑马鱼行为神经科学和神经表型研讨会上跟踪3D斑马鱼

卡鲁耶夫博士意识到缺乏实践教育，开始组织斑马鱼行为神经科学和表型研究研讨会。这些研讨会在2012年10月神经科学学会年会前后举行。这两项活动的结合吸引了来自世界各地的研究人员加入到关于斑马鱼行为神经科学的热烈讨论中。

我也很高兴参加了这个研讨会。我个人参加的原因是满足我对成年斑马鱼高通量筛选和自动视频跟踪的兴趣。这是一个非常有前途的领域，并且已经开发出了优秀的工具。然而，该领域仍处于探索阶段。主要是因为与啮齿动物模型相比，所使用的行为范式没有明确的标准化。卡鲁耶夫博士展示了他在开阔的田野中使用斑马鱼和浅滩实验的研究成果。从表面上看，我自己的工作也使用了开阔的田野和浅滩范式，但我们的工作是相似的或完全可比的吗?不。我相信这两种方法都显示出了希望，并达到了目的，但我的开放场比卡鲁耶夫博士实验中的开放场大几个数量级。这些不同的方法只能说明，在斑马鱼行为研究的世界里，我们还没有建立许多可靠的标准化测试。 Different arena sizes could continue to be used depending on the hypothesis or goal of the study. This is the case for rodent studies as well, but for zebrafish not all approaches have been extensively validated yet.

最近，一些描述斑马鱼协议的书籍已经出版。这些提供了一个有价值的框架，但已建立的方案的数量不像在啮齿动物文献中那样广泛。随着斑马鱼研究的发展，积极的讨论和合作将是高质量研究的驱动力。这次研讨会在很大程度上提供了一个起点。

研讨会的重点是行为表型，特别是行为使用的自动跟踪EthoVision XT．EthoVision的一个特别突出的方面是Noldus的最新开发之一:Track3D．这个EthoVision附加组件可以使用两个摄像头在三维空间中跟踪一个主题。传统上，2D跟踪已经成为标准，但3D跟踪可能在表型行为时提供一些额外的见解或好处。卡鲁耶夫博士用他的实验室对暴露在尼古丁和LSD下的斑马鱼的研究完美地说明了这一点。每种化合物产生的痕迹在2D中看起来有些相似，但在3D中评估时提供明显不同的模式。

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目前，研讨会上展示的数据是一条被3D跟踪的鱼。我的工作是围绕着浅滩进行的，我认为3D追踪是这一领域的一个巨大机遇;最后，我们将能够可靠地跟踪每条鱼，而不会有任何鱼被跟踪程序“切换”或“丢失”。这将我们的讨论带到了浅滩化，以及卡鲁耶夫博士的浅滩化范式。积极的面对面讨论，这多亏了研讨会，带来了一些有趣的差异，我们看到的浅滩或分组行为。卡鲁耶夫博士在一个标准的家庭鱼缸里养了四条鱼，并测量了对药物化合物的反应。我解释了我的范例，我在一个非常大的舞台上用10条鱼，试图模拟浅滩。

当从表面上看我们的论文时，我首先会说，我们以非常不同的方式研究浅滩现象，我们的结果不能相互比较。事实上，仔细观察就会发现，虽然我们对浅滩的测量可能略有不同，不同的浅滩大小，但每种方法都能够回答设计方法的问题。如果没有积极的讨论，这些微妙之处可能不会如此容易地暴露出来。我的研究主要集中在一个大的开阔区域的自然浅滩行为，但为了药物筛选，卡鲁耶夫博士需要一个小的浅滩，限制在一个较小的水箱里。作为科学家，我们必须参与积极的讨论，不仅要更好地理解我们如何研究，更重要的是，为什么要研究。像这样的一个工作室，是最完美的场所。

“我们希望这次研讨会将涵盖连接幼体和成体斑马鱼研究的需求，并改善研究啮齿动物和水生模型的专家之间的对话。最终，这将促进大脑疾病的创新翻译跨领域和跨物种建模。”卡鲁耶夫表示。

由于这次活动的成功，类似的研讨会将在2012-2013年期间每月举行一次。